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在國家自然科學基金項目的資助下，中國科學院華南植物園研究員曾宋君團隊與福建農林大學教授劉仲健合作首次基于葉綠體全基因組數據比較分析了石仙桃屬植物的遺傳變異和進化，探討了石仙桃屬及其近緣屬之間的系統發育和親緣關系。相關研究論文近日發表于《BMC植物生物學》。中國科學院華南植物園副研究員李琳及碩士研究生王婉瑤為該論文共同第一作者。
蘭科石仙桃屬植物分布于亞洲熱帶、亞熱帶地區，世界約有30種，我國產約15種。該屬植物具有重要的經濟價值，其中有些類群為傳統中藥材，俗稱石橄欖。然而，以往由于采樣不足、缺乏足夠的信息位點及有限的基因組信息，該屬和近緣屬間的關系和系統地位尚不清楚，石仙桃屬的分類問題尚存在爭議。
為了解該屬植物的系統發育關系及其葉綠體基因組的變異模式，研究人員對13種石仙桃屬植物的葉綠體全基因組進行了高通量測序、組裝和注釋分析。該研究確定了6個高度可變區域，用于未來的分子標記及相關的遺傳學和基因組學研究。
在綜述之前工作的基礎上，該研究基于葉綠體全基因組序列進一步探討了石仙桃屬及其近緣屬之間的系統發育關系。結果表明，傳統意義上依據唇基囊狀界定的石仙桃屬為多系，分為四個主要分支：狹義石仙桃屬與包含貝母蘭屬部分代表物種的一個分支構成姊妹群；另外兩個分支分別與蜂腰蘭屬和曲唇蘭屬的代表物種聚在一起。盡管唇基凹陷的性狀在石仙桃屬物種間表現出相似性，但經歷了多次獨立進化而產生，為非同源性狀，而石仙桃屬多數分支得到子房是否被毛、花苞片形態等形態共衍征的支持。
該研究結果有助于更好地理解石仙桃屬及其近緣類群的系統發育關系，并為該屬植物的分類、演化和保育奠定了基礎。
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